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易基因 :表观技术 靶基因DNA甲基化和羟甲基化测序 定制精准检测

时间:2022-08-20 01:03:47 | 作者:艾尚平台登录 | 来源:艾尚网址

  原标题:易基因 :表观技术 靶基因DNA甲基化和羟甲基化测序 定制精准检测

  DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。目前研究中常用的DNA甲基化测序方法包括全基因组(WGBS、oxWGBS等)、简化基因组(dRRBS、RRBS、XRRBS等)、靶向基因组(液相捕获)、靶向基因(扩增子)和850K芯片等,适用于多种不同应用场景。

  亚硫酸盐靶基因扩增高通量测序(Bisulfite amplicon sequencing,BA-seq)是针对已有目标基因panel组合,运用易基因自主研发的甲基化特异性多重PCR引物设计软件,对亚硫酸盐转化或氧化亚硫酸盐转化后的目标基因多重扩增,建库后进行超高深度(1000X以上)甲基化和/或羟甲基化精准检测。

  ➢ 适用范围广,对基因组DNA、FFPE样本、游离cfDNA等样本均适用;

  靶基因DNA甲基化测序验证补充维C可减少后代因母亲妊娠期吸烟而发生的DNA甲基化变化

  妊娠期吸烟可能导致婴儿出生后终生肺功能下降。此前已有不少研究描述了孕妇吸烟相关的的DNA甲基化变化,如在分娩时的胎盘和脐血、胎儿肺以及儿童时期的口腔上皮和血液中。本研究为确定补充维生素 C 是否会减少后代因母亲因妊娠期吸烟而发生的甲基化变化。

  对胎盘、脐带血样本和口腔样本进行靶向重亚硫酸盐测序,然后使用靶基因DNA甲基化测序对选定的脐带血差异甲基化区域进行独立验证。

  安慰剂组和非吸烟者组之间甲基化差异≥10%的大多数CpG(69.03%)在补充维生素C后,至少50%可恢复到非吸烟者水平。恢复的CpG中有相当一部分与低甲基化CpG富集程度较高的表型结果相关。

  亚硫酸盐靶基因扩增高通量测序覆盖的所有321个CpG是平均覆盖深度的 337 倍